本课题组主要开展人体共生细菌和病原性细菌的定植、致病与耐药过程和机制研究，利用单细胞测序，RNA测序，RNA互作组测序，CLIP-seq，Tn-Seq合成生物学等先进手段分析微生物基因表达调控，mRNA转录加工，非编码RNA调节机制，新型RNA结合蛋白质的鉴定与功能等研究工作。