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Microbial RNA Systems Biology Unit

Intro block 微生物学,RNA生物学

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Introduction to the laboratory

        晁彦杰博士于2020年9月回国,任上海免疫与感染所研究员、感染与核酸研究室主任、课题组组长、博士生导师,入选各级人才计划,现主持承担国家重点研发计划国际合作项目、国家重点研发计划十四五项目子课题、国家自然科学基金面上项目、中科院先导计划、国合局重点项目、上海市自然科学基金等多个科研项目。在Nature, Molecular Cell, Nature Comm, EMBO J, EMBO Mol Medicine, Emerging Microbes & Infections, Trends in Microbiology等杂志发表30篇高影响力论文,受到Nature等杂志点评和F1000专家推荐,累计引用超过7000次。兼任EMBO J、NAR、mBio等30多家领域权威期刊的审稿专家和BMC Genomics等多家杂志编委,上海微生物学会基础微生物专业委员会委员,中国生物化学与分子生物学会永久会员。

        晁彦杰博士毕业于德国洪堡大学/马普感染生物学研究所,2014-2016在德国维尔茨堡大学、德国与欧盟科学院院士Jörg Vogel实验室进行博士后研究,2016-2020在美国波士顿HHMI/塔夫茨大学医学院进行博士后研究。长期从事病原微生物学和非编码RNA方向的研究,目标为阐释微生物基因表达和调节的分子机制,了解人体共生微生物和病原性细菌定植和感染的过程和机理。通过开发和利用先进的高通量测序技术和系统生物学分析方法,近年来发现并详细鉴定了一类新型的非编码小RNA(来自于细菌信使mRNA的3'非翻译区),致力于对此类小RNA的产生机制和微生物中的RNA代谢过程进行系统性地深入探索。另外,晁彦杰博士参与的RNA工作在细菌中首次发现了II型CRISPR-Cas9免疫防御系统,基于该系统开发的Cas9基因编辑工具革命性地推动了真核生物的基因组编辑,获得了2020年诺贝尔化学奖的认可。

 

       目前本实验室有多个博后和科研助理职位空缺,常年招收实习生与研究生,欢迎对微生物感染与RNA研究感兴趣的博士、硕士、联合培养研究生申请加入实验室,生信分析/实验均可!(申请方法与职位详情参见研究所招聘信息页1招聘信息页2,或通过电子邮件直接联系PI)

关键词:病原微生物,人体微生物,非编码RNA,RNA互作组,RNA结合蛋白,RNA测序,Tn-seq,细菌致病机制,压力应激反应

课题组英文网站:https://yanjiechao.wordpress.com

研究所官方网站:http://www.ips.ac.cn

 

相关新闻报道:

【文汇报】博士期间参与诺奖成果奠基性实验,这个中国小伙完成了“基因剪刀”关键一环

【解放日报-上海观察】“基因剪刀”的两个“刀把”是怎样发现的?他是直接参与该研究的中国人

【新华网】 晁彦杰:第三代“基因剪刀”CRISPR较前两代技术更具优势

【新华网】“解读科学类诺贝尔奖系列讲坛”第三场开讲

【看看新闻】晁彦杰解读2020年诺贝尔化学奖视频资料

【科普中国】晁彦杰2023专访-基因编辑 [文字记录]

晁彦杰课题组诚聘博士后和研究助理(长期有效)[置顶]

感染与核酸功能研究室招聘多名博士后和研究助理

【单位介绍】

    中国科学院上海免疫与感染研究所成立于2004年10月11日,前身为中国科学院上海巴斯德研究所。研究所致力于重大感染性和传染性疾病基础与应用基础研究,创新发展病原学、免疫学和疫苗学理论,突破感染性和传染性疾病免疫防治等关键核心技术,推动新发再发传染病研究国际合作,为全球公共健康提供创新理论、策略和解决方案。

    感染与核酸功能研究室是研究所2024年初正式成立的创新单元,目标为解析病原体感染和宿主免疫过程中RNA的调控与代谢的作用与机制,基于RNA底层技术开发快速检测、新型疫苗和药物,面向生物安全和传染病防治进行关键技术开发。研究室目前拥有3名正高级研究员、5名青年研究员;其中含国家级青年人才1名,中国科学院海外杰出人才1名及海外高层次人才2名,正持续大力引进病原微生物、感染免疫、核酸与疫苗学等相关领域的海内外优秀青年人才加盟。因工作需要,现招聘多名博士后和研究助理。

【导师介绍】

晁彦杰研究员,感染与核酸功能研究室主任,博士毕业于德国洪堡大学和马克思-普朗克感染生物学研究所,先后在德国与美国一流科研机构从事博士后研究。晁彦杰团队首次发现了原核微生物mRNA剪切加工形成的无帽非编码RNA系统;首次建立了活细胞RNA-RNA互作组研究技术,发现了病原细菌的RNA调控中枢;首次揭示了RNA转录终止因子Rof调控病原细菌致病性的分子机制;曾与2020年诺贝尔化学奖得主Emmanuelle Charpentier合作在化脓链球菌中首次发现tracrRNA和CRISPR-Cas9系统,为基因组编辑提供了核心工具。以通讯作者或第一作者在Molecular Cell (x2), Nature Communications (x2), Trends in Microbiology (x2), EMBO Journal, EMBO Molecular Medicine, Emerging Microbes & Infections等一流期刊发表论文30多篇,被引用超过7000次,受到Nature等期刊点评或F1000专家推荐;任EMBO J等30多个期刊审稿人和国家级项目评审专家。课题组目前主持承担国家重点研发计划、国家自然科学基金、中国科学院先导等多个人才与科研项目,课题组成员也获得多个青年基金和博士后项目支持,经费充足,诚邀全国各地优秀毕业生与青年人才加盟共同进步!

一、博士后岗位

1. 微生物学或RNA生物学博士后(编号:CYJ-P-01)2名

2. 疫苗生物学博士后(编号:CYJ-P-022名

【工作内容】

  1. 运用多种RNA测序技术研究RNA-RNA互作组和基因调控机制;
  2. 鉴定病原细菌关键RNA基因及其在感染免疫中的功能;
  3. 研发预防感染或清除病原的新一代疫苗学技术与疫苗制品;
  4. 申请相关科学基金和协助指导研究生。

【任职条件】

  1. 对科研具有浓厚兴趣,认真细致,具有较强的动手能力和英文读写能力;
  2. 年龄不超过35周岁,已经或即将获得微生物学、病原生物学、分子生物学、免疫学等相关专业博士学位;
  3. 以第一作者身份发表过或即将发表SCI研究论文;
  4. 拥有RNA技术、NGS分析或疫苗开发相关研究经历者优先考虑。

 

二、研究助理岗位编号:CYJ-RA-012-3名

【工作内容】

  1. 从事微生物、分子生物学实验和高通量测序样品制备工作;
  2. 从事基因克隆表达、蛋白质表达纯化、抗体水平分析等工作;
  3. 负责实验室运行管理、试剂订购、仪器维护等日常事务;
  4. 参与课题研究,协助开展小鼠试验等。

【任职条件】

  1. 对科研具有浓厚兴趣,态度认真严谨、细致入微,具有熟练的分子生物学实验技能,有一定的实验室运行管理经验;
  2. 年龄不超过35周岁,已经或即将获得生命科学领域相关专业的硕士学位,经验丰富者可放宽至本科毕业;
  3. 拥有测序技术经验者或疫苗研发经验者优先考虑。

 

三、薪酬待遇与职业发展

  1. 研究所提供补充住房公积金、保健津贴、工作餐补贴、交通补贴、职工补充互助医疗保障计划、健康体检等配套福利保障,符合条件的员工还可申请市级或区级租房补贴、纳入事业编制、获得货币化住房补贴、申请上海市户籍等。
  2. 研究所支持博士后申报国家“博士后创新人才支持计划”、中国科学院“特别研究助理资助项目”“中国博士后科学基金”、上海市“超级博士后”及各类科技项目和青年人才项目等 10 余项。博士后全部纳入“中国科学院特别研究助理岗位”,博士后进站即落户上海,在站期间可参与所内副研究员岗位竞聘。

 

四、应聘方式

请将以下应聘材料通过电子邮件同时发至hrips@siii.cas.cn,yjchao@siii.cas.cn邮箱,邮件标题请注明“应聘晁彦杰研究组**岗位(岗位编号***)”。初审合格后,将统一通知面试,择优录用。

  1. 个人简历(中英文)
  2. 自荐信(注明研究方向及兴趣)
  3. 学历学位证书、身份证、专业技能证书扫描件
  4. 2封导师推荐信(应聘博士后需提供,其中一封为博士期间导师的推荐信) 

 

请将应聘材料通过电子邮件发至yjchao [at] ips.ac.cn,邮件主题请注明应聘岗位及编号。如需了解更多课题组的信息,请访问http://www.ips.ac.cn。

 

本岗位自发布招聘启事之日起截至招满为止。初审合格后,将通知面试,择优录用,按中国科学院和上海市的标准提供有竞争力的薪酬待遇。

祝贺实验室研究生以优秀成绩顺利毕业!

2024年5月14日下午,课题组硕士生金思卉同学顺利通过答辩,经答辩委员会专家审核,成绩优秀,成为课题组毕业的第一个学生!

热烈庆贺,祝前程似锦!

2024年上海微生物RNA与转录调控前沿论坛--正式会议通知

       为庆祝上海市微生物学会成立70周年,由上海市微生物学会基础微生物学专业委员会主办,中国科学院上海免疫与感染研究所承办的首届“上海微生物RNA与转录调控前沿论坛”将于2024年1月12-13日在上海免疫与感染研究所举行。本次会议将围绕“微生物基因表达调控”为主题,涵盖细菌转录机制、病毒基因转录调控、RNA功能与病原感染、核酸生物技术等方向,邀请相关领域的专家学者参与交流研讨,为从事基础微生物学研究的一线科研人员提供专业交流平台,鼓励交叉合作创新,促进学科发展升级。

 

一、组织机构

主办单位:上海市微生物学会基础微生物学专业委员会

承办单位:中国科学院上海免疫与感染研究所、RNA功能与应用全国重点实验室(筹)

协办单位:中国科学院分子植物科学卓越创新中心、上海科技大学、上海交通大学、上海市生物工程学会

组委会:  晁彦杰、王程远、张余、季泉江、王权、姚玉峰、欧竑宇、童垚俊

 

二、时间地点

会议时间:2024年1月12-13日

会议地点:中国科学院上海免疫与感染研究所(上海徐汇区岳阳路320号)

日程安排: 2024年1月12日下午—1月13日早上     报到注册

                  2024年1月13日周六全天     大会报告与学术交流

为鼓励现场交流,本次论坛不安排网络直播和视频回放。

 

三、特邀报告人(排名不分先后)

张  余     中国科学院分子植物科学卓越创新中心

王宝俊     浙江大学杭州科创中心生物与分子智造研究院

任艾明     浙江大学生命科学研究院

陈曦子    复旦大学生命科学学院

王  权     上海科技大学生命科学与技术学院

王天民     上海科技大学生命科学与技术学院

郑舰艇     上海交通大学生命科学技术学院

曹蓬勃     西湖大学生命科学学院

宫腰昌利  日本筑波大学医学院

杨  荟     中国科学院分子细胞科学卓越创新中心

张  珂     中国科学院上海免疫与感染研究所

王程远     中国科学院上海免疫与感染研究所

晁彦杰     中国科学院上海免疫与感染研究所

 

四、会议日程 (见海报)

 

五、注册与缴费

1. 报名时间:即日起至2024年1月12日

2. 注册链接:https://www.wjx.cn/vm/mRkJNSN.aspx

3. 注册费标准:

科研机构:500元/人

在校学生:100元/人

企业人员:800元/人

4. 缴费方式:

建议在1月12日之前完成汇款缴费。

汇款注册缴费账户信息:

账户名称:上海市微生物学会

账号:1001251109014425296

开户行名称:工商银行淮海中路第一支行

汇款时请备注:基础微生物+参会人员姓名、电话以及开票信息

5. 发票领取:

如需开具发票,请在注册缴费时提供开票信息;缴费确认成功后,开票信息提交无误的,电子票据将于会议结束后发送至注册邮箱。

 

六、交通与住宿

公共交通:肇嘉浜路地铁站(7号线、9号线)2号口附近

本次会议不统一安排住宿,参会代表可自行联系会场附近酒店。

住宿建议1:好望角大酒店

地址:上海市徐汇区肇嘉浜路500号

住宿建议2:青松城大酒店

地址:上海市徐汇区东安路8号

 

七、联系方式

注册缴费、赞助广告、学术报告、交通食宿等事宜请联系会务组工作人员。

方  霞:13817936077, xfang@siii.cas.cn

邵慧慧:18810932822, hhshao@siii.cas.cn

 

 

上海市微生物学会基础微生物学专业委员会

中国科学院上海免疫与感染研究所

RNA功能与应用全国重点实验室(筹)

2023.12.27

 

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