9 月 之前
转录组:是指特定组织或细胞在某一阶段或状态下转录出来的所有RNA的集合,狭义上是指mRNA
目的:通过该分析可以得到某条件下差异表达基因表达的有用信息
实验可通过专业公司去做,结果分析主要在他们的云平台上,例如美吉云平台,里面会有详细的教程和视频,我们主要对得到的差异表达基因进行可视化分析。筛选潜在的表达通路最主要的途径为GO和KEGG富集分析,可快速帮助我们锁定目标,继而从云平台下载数据,在origin等软件上画图,会比直接在云平台上画图好看很多。但若要获得更多信息,可通过云平台查阅相关基因的文献,这就需要花费精力查找基因,并阅读文献来分析想要说明的问题,这不是一个短期过程,需要锻炼自己的耐心。例如我所研究的课题为细菌对钨的一个抗性机理,我的思路为元素进入胞内、胞内储存、胞外排出,这三个主要过程,因此先查阅文献找寻钨和这三个过程相关的基因,再在云平台上看是否有显著性表达,最后说明问题。此外还有另一个思路,比如KEGG富集结果说明某通路显著富集,然后去查阅文献找到该通路与钨解毒存在的联系,继而说明问题。可见转录组学分析不仅仅是呈现一个数据统计的结果,更主要是将结果与研究目的融合的过程。分析方法B站和云平台都有,更为重要的是查阅文献。大家可参考我的毕业论文的思路去分析。