Chen lab of Molecular and Genomic Evolution
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实验室简介
一、实验室简介
本实验室已利用传统的基因技术，结合测量基因组、转录组、蛋白质组、表观遗传学数据、基因组三维空间数据等高通量测序技术，以及计算建模等生物信息学方法，在分子水平对最基本的生物学问题进行研究与解释。目前在以下三个主要方面，取得了突破性的进展：
1、哺乳动物的性别是由性染色体决定，因此关于性染色体的起源与演化是生物学家长期关注的问题。本人与合作者应用RNA-Seq数据，以及最新发布的人类蛋白质组数据，否定了X染色体基因在进化中表达量加倍的Ohno假说，提出了对性染色体剂量补偿的新观点。
2、突变是所有生物无可避免的最基本的生命事件，长期以来生物学家对其发生的规律和机制进行了大量的研究。本人与合作者利用突变累积等实验和比较基因组学等分析，首次发现DNA突变与核小体的覆盖水平、DNA的转录水平、以及RNA的折叠水平相关。由于肿瘤的发生与DNA突变密切相关，这一发现对理解相关细胞病变具有重要理论价值。
3、生物学家关注“位置效应”对基因表达水平的影响将近100年。本人运用GFP荧光报告系统以及流式细胞技术，在染色体接近500个物理位置，对每个位置大约5万个细胞个体进行基因表达以及表达噪音的检测，发现位置效应与基因表达以及表达噪音有着显著的关系，而且该关系受到组蛋白修饰的调节。该研究提示位置效应能够控制染色体结构的空间组织形态的形成，并为日后基因工程的改良奠定了研究基础。
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