王文宁课题组

常用技术
常规分子动力学模拟
导向分子动力学模拟（SMD）
靶向分子动力学模拟（TMD）
自适应偏置力（ABF）
Metadynamics
副本交换分子动力学模拟（REMD）
伞状抽样+WHAM

实验室设备
专有的小型机房配置有几十台以上的GPU主机，用于分子动力学模拟计算。
主机的典型配置一为：
Intel四核处理器i7-4790K + GTX 770 (或960) + 4G 内存 + 1T 硬盘。
主机的典型配置二为：
Intel六核处理器i7-4930K + GTX 780 Ti + 8G 内存 + 1T 硬盘。
此外，我们也在复旦大学高性能计算中心和国内各大超算中心租用计算机时。

常用软件
Gromacs
VMD
MSM Builder
NAMD
Modeller
Autodock
CHARMM