（1）成功鉴定了在HTLV-1致癌过程中发挥促癌功能的信号通路（非经典Wnt信号通路）和靶基因（Wnt5a），为后续靶向治疗（HBZ或Wnt5a）提供了新的途径（Oncogene, 2013）。

（2）成功解明了HTLV-1特异性感染外周T细胞而不是胸腺T细胞的组织嗜亲性的分子机制，鉴定了两个T细胞特异性的HTLV-1抑制因子，为开发抗HTLV-1感染药物提供了理论基础（PNAS, 2015）。

（3）同药企合作开发了抗病毒药物PPS，在细胞和动物水平解明了其作用机制，并进行了小规模的前临床试验，为其最终的临床使用打下坚实基础（Journal of Virology, 2019）。

（4）采用最前沿的单分子RNA荧光杂交技术（smRNA-FISH），在国际上首次发现人类逆转录病毒包括HTLV-1和HIV-1均编码定位于细胞核的反义链mRNA，且证实该mRNA具备促进逆转录病毒长期感染的能力，可作为逆转录病毒彻底清除的潜在靶点（PNAS, 2021）。

（1）HTLV-1癌基因HBZ通过调控细胞microRNA促进白血病细胞生长的现象和机制研究。

microRNA的研究虽然热度已过，但在HTLV-1感染及ATL发生中的研究相对较少。本课题筛选了HBZ调控的microRNA，以miR-NNN为对象，寻找并确定了其靶基因。目前正在进行miR靶基因的功能研究。

（2）HTLV-1癌基因HBZ RNA的剪切调控机制。

本领域一般认为HBZ有2个剪切产物，sHBZ和usHBZ。本课题通过高通量意外发现HBZ存在其他剪切产物，目前正在分析这些产物存在的生理意义、以及HBZ可变剪切的分子机制。

（3）利用DMS-MapSeq对病毒RNA进行结构预测。

DMS-MapSeq是近年来新开发的RNA结构预测工具，已在HIV-1中有过成功应用（Nature, 2020 Jun;582(7812):438-442）。本课题试图采用此方法进行HTLV-1的相关研究。目前已初步对DMS-MapSeq方法进行了优化改良。

（4）HTLV-1癌基因HBZ RNA的多聚腺苷酸化调控机制。

本课题组此前发现（PNAS 2021）HBZ RNA polyA效率较低，主要原因在于其启动子无法有效募集下游pA因子。作为延续性研究，本课题组提出启动子强弱决定pA效率的假说，并采用诱导表达系统进行了初步的验证。目前正在寻找合适的高通量测序方法以一次性获得大量pA尾长度的信息。

（5）HTLV-1癌基因HBZ靶基因探索。

HBZ作为在HTLV-1感染细胞及ATL细胞中一直存在的基因，必然与感染细胞的存活密切相关。本课题组试图通过对比HBZ过表达和敲低两种情形下的细胞转录组变化，搜寻可能的HBZ靶基因进行深入研究。

（6）由AZT/IFN疗法的有效性入手，探索新的ATL靶向手段。

ATL缺乏有效的治疗手段，AZT/IFN作为抗病毒疗法却对相当一部分ATL患者有效。本课题试图通过多组学手段探索AZT/IFN疗法有效背后的分子机制，希望能够鉴定以往未能发现的全新ATL靶点，为ATL治疗提供新的思路。

（7）HIV和HTLV的比较性研究。

二者基因组结构相似，均感染CD4 T细胞，但对细胞的影响截然不同。本课题着眼于二者的转录激活蛋白Tat和Tax，通过对其功能的对比，尝试为两种病毒不同致病机制提供一些可能的解释。

（8）TCF家族蛋白对HTLV-1基础转录活性的影响。

延续此前发现（PNAS 2015），本课题组进一步发现TCF1 LEF1具有不依赖于Tax的抗HTLV-1活性，目前正在对其机制和生理意义进行深度解析。

（9）HTLV-1在压力条件下的转录调控。

在无葡萄糖等压力条件下HTLV-1的基因转录此前已有少数报道，本课题聚焦于病毒RNA特别是HBZ的亚细胞定位，通过RNA-FISH确定在压力条件下HBZ是否存在由RNA至蛋白的功能转变。

（1）利用转基因斑马鱼进行病毒基因功能的研究。

斑马鱼虽然不如小鼠与人亲缘关系近，但某些疾病确实存在成功的斑马鱼模型。病毒感染依赖于受体的存在，所以斑马鱼往往无法直接感染人类病毒。本课题组故而希望通过转基因的方式来研究病毒基因的功能，这样也避免了病毒感染操作等潜在的风险。

（2）ATL靶向药物研发。

课题组前期发现ATL中有几个上调基因有可能作为原癌基因发挥功能，故希望进行靶向药物的设计和筛选，看能否获得对ATL有效的小分子化合物。

（3）HTLV-1转基因鼠的构建。

Tax和HBZ单转基因鼠均可产生疾病表型，然而无法重现ATL。本研究试图基于合理猜测构建可调控双转基因鼠，以验证ATL发生是否需要Tax和HBZ的协作。