Forest Protection and Plant Microbiology Lab

Structure and function of rhizosphere microbiome in forest.

袁志林
Principle Investigator

袁志林

Principle Investigator


袁志林,男,1979年9月出生,籍贯江苏苏州,博士、研究员、博士生导师。2002年本科毕业于南京师范大学生物科学专业,2005年硕士毕业于南京师范大学生命科学学院微生物学专业,同年到亚林所工作至今,2010年博士毕业于浙江大学农业与生物技术学院植物病理学专业,2012-2013年,在维也纳理工大学化学工程研究所基因技术与应用生物化学系做访问学者。   现任林木遗传育种国家重点实验室青年PI、应邀担任美国国家地理学会(National Geographic Society)项目同行评审专家、美国菌物学会(Mycological Society of America)会员、中国菌物学会永久会员、欧洲科学技术合作COST联盟FA1103(Endophytes in Biotechnology and Agriculture)行动计划会员。   围绕“共生菌群落结构和生态学功能”主题开展多项课题研究,在根际、根内生功能微生物定向筛选、DSEs真菌-根系互惠关系、地下微生物组结构和组装机制等方面取得重要进展,旨在创制新型植物接种剂。   先后主持国家自然科学基金青年项目、面上项目和优秀青年项目、浙江省科技厅公益技术研究农业项目、中央级公益性科研院所基本科研业务专项资金(重点项目)、国家林业局引智项目等;获国家发明专利3项,以第一作者(含通讯)发表SCI论文17篇,累计IF超过50,单篇最高IF是11.847;SCI论文总他引次数200余次,单篇最高他引51次。2011年度获中国林科院亚热带林业研究所“先进个人”、2012年度获得第四届梁希青年论文奖三等奖、2012年获浙江省自然科学学术奖论文二等奖、论文“植物与内生真菌互作的生理与分子机制研究进展”被《生态学报》编委会评选为2008-2012年度优秀论文(共50篇)、2014年入选第四届中国林业科学研究院杰出青年、入选2016年度浙江省“151”人才工程第二层次培养人员、第十四届中国林业青年科技奖获得者(2017年)、入选国家林业和草原局第五批“百千万人才工程”省部级人选(2018年)。

Email: zlyuanmycology@gmail.com

In lab: 01.03.2008 - Till present

陈连庆
Research professor

陈连庆

Research professor


陈连庆(1943.5- ),男,河北唐山人,毕业于河北农业大学;硕士研究生导师;曾任浙江省林业土壤专业委员会副主任。1978年调入所,曾从事林木菌根研究和食用菌、药用菌研究与开发工作。享受国务院政府特殊津贴。2008年退休。 主要获奖成果: 1. 《林木菌根及应用技术》   (1992年)林业部科技进步二等奖,国家科委科技进步二等奖    2. 《竹荪室外生料栽培技术》   (1988) 林业部科技进步三等奖    3. 《林木菌根及应用技术》   (1992年)林业部科技进步二等奖    研究方向: 菌根生物技术;兰科菌根。

In lab: 03.09.2002 - 30.12.2008

彭龙
Research Scientist

彭龙

Research Scientist


彭龙,男 ,出生于1988年4月26日,河北农业大学生物技术学士,河北农业大学植物学硕士,,北京林业大学 生物化学与分子生物学博士。 主要科研成果: Peng L, Lang S, Wang Y, et al. Modulating role of ROS in re-establishing desiccation tolerance in germinating seeds of Caragana korshinskii Kom. [J]. Journal of Experimental Botany, 2017, 68(13):3585-3601. Peng L, Sun Q, Xue H, Wang XF. iTRAQ-based quantitative proteomic analysis reveals pathways associated with re-establishing desiccation tolerance in germinating seeds of Caragana korshinskii Kom. [J]. Journal of Proteomics, 2018, 179:1-16. Peng L, Zhao Y, Zhao Z, et al. Cloning and expression of a tau class glutathione S-transferase (ZjGSTU1) from Chinese jujube in response to phytoplasma infection [J]. Acta Physiologiae Plantarum, 2014, 36(11):2905-2913. Bu J, Peng L, Liu M, et al. 16S rDNA sequence analysis of witches’ broom phytoplasma isolates from Chinese jujube in North China [J]. Australasian Plant Pathology, 2016, 45(1):119-122. Peng L, Liu Z G, Yuan Z, et al. Genetic diversity of phytoplasmas associated with jujube witches' broom disease in ziziphus jujube mill. 'Dongzao' [J]. Acta Horticulturae, 2013, 993(993):125-130.(ISTP) Liu Z G, Peng L, Xiao J, et al. Evaluation of table cultivars of Chinese jujube (Ziziphus jujube Mill.) in gravel gobi of Southern Xinjiang. [C]// II International Jujube Symposium, Xinzheng, China. 2013. (ISTP) 赵彦檩,彭龙,赵锦,刘孟军.枣MAPK基因片段克隆与分析[J]. 河北农业大学学报,2010,33(6):43-46. 刘雅倩, 彭龙, 宁强,等. 枣疯病植原体对枣树叶绿素及几种保护性酶的影响[J]. 华北农学报, 2012, 27(2):213-217. 谢南南, 崔明稳, 彭龙,等. 枣黄化根蘖苗成因分析[J]. 园艺学报, 2012, 39(10):1919-1927.

Email: pengyanlong2006@sina.com

In lab: 01.07.2018 - 18.05.2018

杨预展
Research Scientist

杨预展

Research Scientist


杨预展,女,安徽淮北 教育经历: 2007.09~2011.07 合肥工业大学 生物工程 工学学士 2011.09~2016.12 中国科学技术大学 生态学 理学博士 2014.01~2016.12 中国科学院生态环境研究中心 生态学 理学博士 2017.01~2019.06 中国科学院生态环境研究中心 环境科学 博士后 2019.06~至今 中国林业科学研究院 亚热带林业研究所 学术成果: 1. Y Yang, A Zhan, L Cao*, F Meng, W Xu. 2016. Selection of a marker gene to construct a reference library for wetland plants, and the application of metabarcoding to analyze the diet of wintering herbivorous waterbirds. PeerJ, 4: e2345.IF5y= 2.469. 2. Y Yang, Y Deng, L Cao*. 2016. Characterizing the interspecific variations and convergence of gut microbiota in Anseriformes herbivores at wintering areas. Scientific Reports,6:32665.IF5y= 4.609. 3. Yang Y, P Ni, Y Gao, W Xiong, Y Zhao, A Zhan*. 2018. Geographical distribution of zooplankton biodiversity in highly polluted running water ecosystems: validation of fine-scale species sorting hypothesis. Ecology and Evolution.IF5y= 2.788. 4. Y Yang, Y Gao, X Huang, P Ni, Y Wu, Y Deng, A Zhan*. 2018. Adaptive shifts of microbial communities and reduced microbial interactions along a nitrogen gradient in highly polluted running water ecosystems. Environmental Pollution (minor revision). IF5y= 5.291. 5. Y Yang, S Li, Y Gao, Y Chen, A Zhan*. 2018. Environment-driven geographical distribution of bacterial communities and identification of indicator taxa in Songhua River. Ecological Indicators (minor revision). IF5y=4.391. 6. A Zhan, P Ni, W Xiong, Y Chen, Y Lin, X Huang, Y Yang, Y Gao. 2017. Biological invasions in aquatic ecosystems in China, in book: Biological Invasions and Its Management in China. Springer. 7. W Xiong, Y Yang, A Zhan*. 2018. Reliability of simplifying strategies for rapid biodiversity assessment in studying community-environment interactions. Ecological Indicators, 85: 861-868.IF5y= 4.391. 8. W Xiong, J Li, Y Yang, W Wang, B Shan, A Zhan*. 2018. An integrated ecological survey of rotifer communities and corresponding environmental variables in the highly polluted Haihe River Basin, China. Data in Brief (of Ecological Indicators). 9. Y Wu, Y Yang, L Cao, H Yin, M Xu, Z Wang, Y Liu, X Wang, Y Deng*. 2018. Habitat environments impacted the gut microbiome of long-distance migratory swan geese but central species conserved. Scientific Reports,8:13314. IF5y=4.609. 10. Y Yang, Y Gao, Y Chen, S Li, A Zhan*. 2018. The abiotic and biotic determinants of community structure in a floodplain wetland plankton interactome. Diversity and Distributions. I5y= 4.777 (Expected submission date: 1stNovember 2018). 11. Y Yang, X Huang, Y Gao, P Ni, Y Zhao, S Li, Y Wu, Y Deng, A Zhan*. 2018. Nutrient enrichment strongly diverges the seasonality of bacterioplankton community in a highly disturbed river. Microbiome. IF5y= 10.903 (Expected submission date: 1stFebruary 2019). 学术会议: 2014,第 16 届国际雁类专家组会议,北京;职责:协助 和 服务会议组织; 2016,冷泉港(亚洲 )微生物与环境会议,苏州;口头报告, 题目: Characterize the gut microbiota of wintering herbivorous geese; 2017,第 14 届国际厌氧大会,北京;职责:协助和服务会议组织; 2018,海洋与淡水入侵生物国际研讨会,北京;职责:协助和服务会议组织; 2018, 第34届国际湖沼学大会,南京;口头报告, 题目: Adaptive shifts of bacterioplankton and reduced microbial interactions along a nitrogen gradient in highly polluted river ecosystems. 项目参与: 2014.01~ 201 7.12 国家自然科学基金面上项目,三种食草雁类越冬地食物生态位分化机制研究;职责: 负责雁类食性分析方法的建立以及食性组成的比较分析,并撰写和发表相关论文; 2015.04 ~ 2019.12 国家科技支撑项目,水产养殖与环境治理技术研究与示范—湖泊渔业及其水环境调控技术研究与示范—湖泊渔业承载力调控与环保渔业技术研究;职责:全权负责实验设计、数据处理以及报告撰写; 2015 .01 ~ 201 8.12 水体污染控制与治理科技重大专项,松花江典型水生生物类群退化机制研究;职责:负责松花江浮游微生物类群退化机制研究,包括实验设计及样品采集、数据分析、文章撰写; 2016.07 ~ 2020.12 ,国家重点研发计划“典型脆弱生态修复与保护研究”重点专项,子课题“迁徙水鸟淡水湿地栖息地退化监测与评估研究”;职责:构建以微小型浮游生物为主体的湿地退化监测与评估体系,负责相关实验设计、样品采集、数据分析、文章撰写,以及项目报告撰写。 学术服务: 为 Biological Invasion, Journal of Lake Science (湖泊科学)等国际国内期刊审稿 。 项目主持 国家自然科学基金青年基金,多组学技术联合解析河流微生物群落对氮添加的响应,2019.01 ~ 2020.12, 24 万元。 荣誉奖励: 2007~2011,连续四年被评为合肥工业大学“三好学生”; 2007~2011,连续四年获得合肥工业大学校级二等奖学金; 2008,获得国家励志奖学金; 2010,获得全国大学生英语竞赛(C类)第二名; 2011,获得合肥工业大学优秀毕业生称号。

Email: yyzhan@mail.ustc.edu.cn

In lab: 03.06.2019 - Till present

姚佳佳
Technician

姚佳佳

Technician


毕业于北京林业大学,已经在袁志林老师实验室工作了6年多,认真负责,管理实验室的大小事务。

In lab: 07.10.2011 - Till present

朱志勇
Technician

朱志勇

Technician


教育背景:硕士:中国林业科学研究院 经济林学专业,2016.09-2019.06 本科:黄山学院 林学专业,2012.09-2016.06 荣誉证书:  2012.9-2016.6 担任班级班长,获优秀志愿者、“三好学生”、“优秀学生干部”等称号;  2016.10-2018.10 获中国林业科学研究院一、二等奖学金,国际竹藤中心“绿水青山就是金山银山”主题 演讲一等奖和宿舍安全与卫生评比活动各批次一等奖;  2017.2-2018.3 担任国际竹藤中心第八党支部组织委员。 担任职务及奖项: 全国计算机“C 语言程序设计”、CET-4 级、熟练 SPSS、Word、Excel、PPT 等办公软件以及常规田间试验设计与统计分析 发表论文: [1] 朱志勇,陈晓东,张韫等.花龟竹与龟甲竹的光合荧光特性比较[J].甘肃农业大学,2019,54(4). [2] 张韫,张玲,朱志勇,等.宜兴苦竹开花结实首次记录[J].热带亚热带植物学报,2018,26(2):171-177. [3] 陈晓东,朱志勇,张韫等.竹子基因报告(~2015 年)[J].南方林业科学,2016,44(6):38-40. 实践经验 2012.9-2016.6 策划主持班级活动:两球联谊、植物鉴定大赛、辩论赛及趣味运动会等活动并成功申报优良学 风班级,协助辅导员完成每年度学生奖项评分和安全宣传工作。 2013.5-2016.6 参加“大片段胡杨基因转导拟南芥实验”,并前往浙江亚林所学习拟南芥基因转导实验;另参 与“杉木与毛竹林混交林的生长量调查”、“安徽省有害生物资源调查”和“国外松遗传测定林调查”;本科专 业实习在安徽岭南林场和浙江天目山进行区域大小班林木资源调查及森林植物群落与土壤剖面调查,并参加过 黄山学院第一届大学生创新创业项目(食品纳豆)并获审批。 2016.9-2017.5 参与国际竹藤中心竹类标本馆建设和北京园科院的大气试验和北京副中心热岛效应试验。 2017.3-2018.5 参与国家毛竹种质资源库建设,历经 12 省 34 县,对我国主要的高产毛竹林进行了引种栽培。 2019.9-2020.12 温室大棚苗木养护及室外栽培技术(半年老外教),和各林业局、基金会及企业开展碳汇项目开发及出售相关业务,调研小食品(饮料、饼干及代餐食品)市场状况。

Email: 2371553606@qq.com

In lab: 28.12.2020 - Till present

秦媛(已经毕业)
Master student

秦媛(已经毕业)

Master


教育经历 2010年-2014年 学士学位 河北农业大学植物保护学院 植物保护专业 2014年-2017年 硕士学位 中国林科院亚热带林业研究所 森林保护学专业 1. 以第一作者发表论文4篇 [1] Yuan Qin, Irina S. Druzhinina, Xueyu Pan, Zhilin Yuan. Microbially mediated plant salt tolerance and microbiome-based solutions for saline agriculture. Biotechnology Advances, 2016. (34): 1245–1259; [2] Yuan Qin, Xueyu Pan, Zhilin Yuan. Seed endophytic microbiota in a coastal plant and phytobeneficial properties of the fungus Cladosporium cladosporioides. Fungal Ecology, 2016.(24): 53-60. [3] Yuan Qin, Xueyu Pan, Christian P. Kubicek, Jessy Labbé, Zhilin Yuan. Diverse plant-associated pleosporalean fungi from saline areas: ecological tolerance and nitrogen-status dependent effects on plant growth. Frontiers in Microbiology, 2017. 8:158. doi: 10.3389/fmicb.2017.00158. [4] 秦媛, 潘雪玉, 袁志林. 利用PCR技术检测根际产ACC脱氨酶细菌. 生物技术通报, 2017, 33(11): 112-122. 2. 参与实用新型专利1项 [1] 植物组织表面消毒的简易装置。专利号:ZL201520638815.2。 2016年。排名第3。 3. 其他科研成果 [1] Zhilin Yuan, Irina S. Druzhinina, Jessy Labbé, Regina Redman, Yuan Qin, Russell Rodriguez et al. Specialized microbiome of a halophyte and its role in helping non-host plants to withstand salinity. Scientific Reports. Aug 30; 6:32467. (主要贡献:绘制根际微生物群落结构模式图) 主要获奖情况 2017年 3月 第六届梁希优秀学子奖 2016年12月 研究生国家奖学金 2016年11月 中国林业教育学会"北美枫情杯"2017届全国林科优秀毕业生奖; 2016年 9月 中国林科院"学位证书设计比赛"三等奖; 2015/ 2016年 6月 中国林科院亚林所研究生二等奖学金两次. 目前学习单位:中国科学院微生物研究所攻读博士学位

In lab: 01.02.2016 - 30.06.2017

潘雪玉(已经毕业)
Master student

潘雪玉(已经毕业)

Master


本科就读于福建农林大学,2016年在亚林所袁志林老师攻读硕士学位,期间发表了多篇核心期刊论文和SCI论文。 目前学习单位:中国林业科学研究院热带研究所攻读博士学位

In lab: 01.09.2017 - 01.07.2018

靳微(已经毕业)
Master student

靳微(已经毕业)

Master


In lab: 03.12.2017 - 06.12.2019

何兴华
Master student

何兴华

Master


2018年毕业于山东农业大学

In lab: 01.03.2018 - Till present

单晓亮
Master student

单晓亮

Master


2018年毕业于山东农业大学,黑龙江人。爱好广泛。

In lab: 03.05.2018 - 02.07.2020

韦焕深
Master student

韦焕深

Master


河南新乡人,2019年毕业于河南科技大学林学院林学专业。

Email: weihuanshen_2015@163.com

In lab: 01.04.2019 - Till present

王玉宸
Master student

王玉宸

Master


陕西西安人,2019年毕业于海南大学(211)热带农林学院,园艺专业。 参与项目: 1. 海南省重大科技计划项目(zdkj201815):热带花卉(三角梅、文心兰)优质高效生产技术研究与示范,专题一“文心兰多性状品质改良及高效优质生产技术应用集成与示范”,主要负责文心兰病害回接验证。 2. 大学生创新创业基金创新项目(Hdcxcyxm201713):热带大型真菌资源的DNA条形码数据库构建,主要负责DNA的提取分析。

Email: 729813985@qq.com

In lab: 01.04.2019 - Till present

王科选
Master student

王科选

Master


山西闻喜人,本科毕业于山西农业大学林学专业。

Email: wkxxuan@163.com

In lab: 18.06.2020 - Till present

张宇薇
Master student

张宇薇

Master


毕业于沈阳农业大学,生物工程专业

Email: zyw980115@163.com

In lab: 01.07.2020 - Till present

刘慧慧
Intern

刘慧慧

Intern


In lab: 01.04.2017 - Till present

王新翔
Intern

王新翔

Intern


In lab: 01.05.2017 - Till present

吴佳敏
Intern

吴佳敏

Intern


In lab: 12.06.2017 - 13.05.2018

李策
Intern

李策

Intern


姓 名:李策 性 别:男 籍 贯:山东省城阳区 民 族:汉 政治面貌:共青团员 学校:山东省聊城大学 院 系:生命科学学院 专 业:生物工程 平均绩点:4.02 手机号码:17895819280 E-mail:1098274966@qq.com 奖励或荣誉: 2016年11月,浙江省第八届大学生生命科学竞赛获得二等奖。 2017年11月获全国大学生生命科学竞赛三等奖。 2016年7月参与聊城大学暑假社会实践,获聊城大学暑假社会实践先进个人。 2017年12月参与聊城大学寒假社会实践,获聊城大学寒假社会实践先进个人。 2016年获得聊城大学二等奖学金。 2017年获得聊城大学二等奖学金,泉林二等奖学金,校级优秀学生干部。 2017年11月,山东省大学生科技节生物医药实验技能大赛获得优秀奖。 2018年3月,山东省高等学校优秀学生,颁奖单位:山东省教育厅。 2018年5月,获聊城大学优秀团员。 科研工作: 2016年5月~11月,参与“高产几丁质菌株得筛选”项目的研究,指导老师聊城大学生科院张扬老师,成果:此项目在浙江省第八届大学生生命科学竞赛获得二等奖。 2017年5月~2017年11月,参与聊城大学大学生科技文化创新基金项目“金耳多糖的提取纯化及抗氧化活性的分析”。指导老师聊城大学生命科学学院杜秀菊教授,成果:项目相关的课题“金耳多糖纤维素酶提工艺优化及其初步结构研究”以第二作者身份已被《天然产物研究与开发》接收。 2017年4月~2017年10月,参与“泰山地衣多样性及其生物地理学研究”项目,指导老师聊城大学生命科学学院贾泽峰副教授,成果:该项目获全国大学生生命科学竞赛三等奖。 2017年7月~8月,于中国林业科学研究院亚热带林业研究所,参与研究“林木根际微生物组结构和功能”。指导老师,中国林科院亚林所袁志林副研究员。 发表的论文、出版物或原创性工作: “金耳多糖纤维素酶提工艺优化及其初步结构研究”以第二作者身份已被《天然产物研究与开发》接收。

In lab: 01.09.2017 - Till present

周亚斌
Intern

周亚斌

Intern


92年生人,蒙古族,2016年毕业于内蒙古农业大学,学习的专业为森林资源保护和游憩,目前工作中,选择工作后考研;性格诚实、勤奋、热爱健身,热爱生活。

In lab: 06.06.2018 - 09.08.2018

Working at: 呼和浩特市托克托县森林保护站

王海萍
Intern

王海萍

Intern


生日1998.10.01,山东省潍坊人,毕业于山东省青州实验中学,大学还未报到。

In lab: 25.06.2018 - 10.07.2018

张梦莹
Intern

张梦莹

Intern


浙江省余姚市人,出生于1998-11-03,浙江理工大学本科生大二在读,正在学习的专业是海洋资源开发技术浙江省余姚市人,性格开朗,待人友好,为人谦虚,工作认真负责、积极主动、具有较高的学习能力。

Email: 1204977738@qq.com

In lab: 07.07.2018 - 10.08.2018

孙宁宁
Intern

孙宁宁

Intern


就读于山东农业大学,森林保护专业,专业课成绩中游,喜欢钻研,对根际微生物及植物病害的生物防治感兴趣,希望有机会从事相关科研工作;勤勉务实,注重理论与实践的有效结合,专业课实验实习仔细认真;责任心强,对待工作尽职尽责;进取意识烈强烈,虚心好学;有团队意识,曾多次组织并带领团队参加创新创业大赛、担任植保女篮副队长,并担当球队中的组织后卫。

Email: 1421837407@qq.com

In lab: 15.07.2018 - 31.08.2018

吕绪聪
Intern

吕绪聪

Intern


学校:聊城大学生命科学学院 专业:生物工程 联系电话:18563540239 工作经历: 2017年4月开始参加学院苗老师负责的“全国生物多样性示范观测——繁殖鸟类观测记录(聊城样区)”项目,之后开始参与校园鸟类调查活动,每月定期观察,记录数据并分析统计。 2017年6月与学院王新翔学长共同申请大学创业基金,目前课题进展顺利。 2017年11月参加本院贾少波老师的“聊城市机场鸟类生态环境分析”项目 2018年3月参加全国大学生生命科学竞赛,比赛题目为《利用DNA Barcoding 技术快速鉴别线虫种类,该比赛仍处于进行阶段 2018年5月带领学院队伍参加济宁太白湖全国青年观鸟大赛,并取得优异成绩。 2018年6月参加林科院荒漠化研究所马强老师的“赤腹鹰长繁殖生态学研究”项目。

In lab: 07.08.2018 - Till present

韩梦雪
Intern

韩梦雪

Intern


In lab: 12.01.2019 - 27.01.2019

褚梦迪
Intern

褚梦迪

Intern


In lab: 12.01.2019 - 28.01.2019

苏静澜
Intern

苏静澜

Intern


浙江中医药大学滨江学院药学院2018级本科生

Email: 2432893907@qq.com

In lab: 01.08.2020 - Till present

何莹
Intern

何莹

Intern


浙江中医药大学滨江学院2018级本科生,热情开朗,能文能武。

Email: 1921669426@qq.com

In lab: 01.10.2020 - Till present

Admin

Zhilin Yuan
Admin